Sebastián Alberto Battaglia Jr, primo segundo del actual número 5 de Boca, surgió de las inferiores y apenas se lo pudo ver jugando en Primera División: solo sumó 129 minutos en 2 partidos oficiales. Su presentación fue un 22 de enero de 2008 ante Racing en el Torneo de Verano en Salta. Esa noche ingresó en lugar del "Tano" Gracián cuando faltaban nueve minutos para el final. Luego de ese partido, viendo que no iba a tener muchas oportunidades, decidió marcharse a préstamo al Unión Maracaibo de Venezuela que disputaría la Copa Sudamericana. Esto decía a su llegada: "...me llamó la atención este equipo que enfrentó a Boca en la Libertadores pasada y la principal expectativa que hay es la Copa Sudamericana. Poderla jugar me llena de ilusión...". Además, así se describía como jugador: "...puedo jugar por izquierda en ofensiva, pero también me puedo adaptar en la contención jugando como doble pivote. Eso lo hice cuando estuve en la selección argentina y en Boca compartí esa función con Ever Banega. Me puedo adaptar perfectamente donde el profesor lo desee...".
Vencida la cesión de seis meses por parte del equipo venezolano, retornó a Boca en donde bajo la tutela (?) de Carlos Ischia pudo debutar oficialmente en el primer equipo. Fue por la novena fecha del Clausura 2009 en el Estadio Único de La Plata cuando un Boca plagado de suplentes cayó ante Estudiantes 0-1. Esa tarde tuvo una aceptable actuación aunque no escapó de la mediocridad del equipo cuyas chances de pelear ese certamen se diluían con el correr de las fechas. En el encuentro siguiente, Boca recibía a River en La Bombonera pero Battaglia no figuró ni siquiera entre los concentrados. Sin embargo, una fecha más tarde volvería a ser titular en Rosario ante Central en la derrota 0-2. Esa sería la última vez de Junior con la camiseta de Boca ya que a los pocos meses fue transferido a Quilmes en donde alternó la titularidad en el equipo que pudo ascender a Primera en la temporada 2009/2010. La llegada de Tocalli al club del sur y la renovación completa del plantel no le permitieron a Battaglia continuar en el Cervecero y jugar en Primera, motivo por el cual se fue a Tucumán para jugar en el "Decano".
